上帝视角之 mNGS 检测
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2021-04-27

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第一部分:病例描述

患者,男,68 岁,以「反复发热伴咳嗽、咳痰 1 个月,加重 2 天」为主诉 2020-4-26 入院我院呼吸科,既往有「慢性淋巴细胞白血病」病史 6 年余,未治疗。

1 个月前无明显诱因出现发热,最高体温 38.0℃,伴有咳嗽、咳痰,痰白,量少,不易咳出,伴畏冷,无寒战,无鼻塞、流涕,无头晕、头痛,无胸闷、胸痛、心悸等,自服用退热药后体温可降至正常,未诊治,上述症状反复,近 2 天加重,伴有活动后气促,休息后可缓解,无咳血、盗汗,无关节痛、皮疹,无腹痛、腹泻等,就诊我院,查「肺部 CT 示:1、双肺散在炎症,2、双侧胸腔积液,纵隔、双侧腋窝扫及多发肿大淋巴结」。自发病以来大小便正常,体重未见明显改变。

 

第二部分:常规检测结果、常规病原学检测结果等

  日期

项目

4-27

4-30

5-7

5-20

6-1

6-22

WBC*10^9(L)

4.28

 

3.2

4.03

5.79

6.21

中性粒细胞%

38.3

 

26.6

40.2

38.6

14.2

淋巴细胞%

57

 

69.4

57.9

51.1

65.5

血红蛋白(g/L

76

 

68

65

69

72

PLT*10^9(L)

164

 

99

61

114

238

PCT(ng/ml)

0.186

 

0.712

0.135

0.308

 

人免疫缺陷病毒抗原抗体

阴性

 

 

 

 

 

半乳甘露聚糖

阳性

 

阳性

 

 

 

真菌葡聚糖

阴性

 

 

 

 

 

隐球菌荚膜抗原

阴性

 

 

 

 

 

血结核抗体

阴性

 

 

 

 

 

痰找抗酸杆菌

 

阴性

 

 

 

 

呼吸道感染八联病原抗体IgM

阴性

 

 

 

 

 

痰细菌培养

 

阴性

阴性

阴性

 

 

痰真菌培养

 

白念珠菌(4-26送检)

阴性

阴性

 

 

胸腔引流液培养

 

阴性

 

 

 

 

胸水找瘤细胞

 

阴性

 

 

 

 

血培养

 

阴性

马尔尼菲蓝状菌(4-26送检)

阴性

阴性

 

Tmax(℃)

39.2

39.0

36.8

40.0

36.0

36.9

注:WBC:白细胞计数;PLT:血小板计数,PCT:降钙素原;Tmax:当日最高体温;呼吸道感染八联病原:嗜肺军团菌、肺炎支原体、肺炎衣原体、腺病毒、呼吸道合胞病毒、甲型流感病毒、乙型流感病毒、副流感病毒。

2020-4-27 胸水定位彩超:右侧胸腔见大量液性区,左侧胸腔见少量液性区。

2020-5-7 肺部 CT:1、双肺散在炎症;2、心包少量积液,左侧胸腔少量积液,右侧胸腔中量积液,较前稍减少;3、纵隔、双侧腋窝及扫及颈部多发肿大淋巴结。

2020-5-20 肺部 CT:1、双肺多发炎症,较前稍进展;2、心包少量积液,双侧胸腔少量积液,较前稍减少;3、纵隔、双侧腋窝及扫及颈部多发肿大淋巴结。

2020-6-5 肺部 CT:1、双肺少许炎症,较前吸收;2、心包及双侧胸腔少量积液;3、纵隔、双侧腋窝及扫及颈部多发肿大淋巴结。

 

第三部分:mNGS 检测

送检时机:2020-5-20 就诊血液科,患者入院前仍有发热,复查血常规示血小板呈进行性下降,为进一步评估感染病原体及既往治疗效果,送检了 mNGS,送检时患者体温已降至正常。

送检时间:2020-5-21

标本类型:外周血。

送检次数:1 次。

结果回报:2020-5-22 马尔尼菲蓝状菌,序列数 2,相对丰度 0.2%。

 

第四部分:鉴别诊断

诊断:肺部感染 双侧胸腔积液 血流感染(马尔尼菲蓝状菌)慢性淋巴细胞白血病

鉴别诊断:1、肺结核:常有全身中毒症状,如午后低热、盗汗、疲乏无力等,临床表现为咳嗽、咳痰、咯血,肺部影像学见哑铃影或密度大小分布均匀的结节,可伴有肺门或纵隔淋巴结肿大,经久不愈的可形成空洞,痰中可找到结核分枝杆菌。2、肺癌:常发生于高龄,有吸烟史患者,表现为刺激性呛咳、长期痰中带血或咯血,肺部影像学可见团块影或毛刺征,肺门淋巴结常肿大,痰中可找瘤细胞,肿瘤标志物可升高,病理活检是明确诊断。3、间质性肺炎:主要由病毒,非典型病原体引起,临床常表现为咳嗽、咳痰、气促,肺部 影像学可见肺组织间质多发网状影、粗线条状影,肺泡内可有炎症渗出改变。

 

第五部分:治疗经过及预后

2020 -4-26 入院后行「右侧胸腔穿刺引流术」,予「头孢噻肟+利奈唑胺」抗感染治疗,但患者仍有持续高热,于 2020-4-29 调整抗感染方案为「替加环素+利奈唑胺」,于 2020-4-30 加用伏立康唑覆盖真菌,甲强龙抗炎,未再发热,咳嗽、咳痰好转。

2020-5-20  转入我院血液科前,患者再次发热,伴畏冷、寒战,最高体温 40.0℃,伴有咳嗽、咳痰,于 2020-5-21 予「头孢哌酮舒巴坦钠+左氧氟沙星」抗细菌,2020-5-21 送检 mNGS,2020-5-22 外周血 mNGS 结果回报:马尔尼菲蓝状菌,予「头孢哌酮舒巴坦钠+左氧氟沙星+两性霉素 B 脂质体(2020-5-22 至 2020-6-7)」、「伊曲康唑(2020-6-8 至 2020-6-30)抗真菌」,患者未再发热,咳嗽、咳痰好转,一般情况可,为进一步治疗慢性淋巴细胞白血病,2020-7-1 患者开始口服伊布替尼治疗(BTK 抑制剂),考虑三唑类真菌药影响 BTK 抑制剂代谢,调整抗真菌方案为氟胞嘧啶(2020-7-1 至 2020-8-8)。

 

案例总结:

第一次入住我院呼吸科时,考虑该病例是一个高龄合并肿瘤的患者,以发热伴咳嗽、咳痰为主要表现,肺部影像学见炎症及胸腔积液,未见明显真菌感染改变,入院后考虑「社区获得性肺炎」,先后以「头孢噻肟+利奈唑胺、替加环素+利奈唑胺」抗细菌方案治疗,但患者仍有持续发热,后来半乳甘露聚糖检查阳性,提示真菌感染,改「替加环素+利奈唑胺+伏立康唑」方案治疗,患者症状改善,入院 10 天后血培养结果回报示「马尔尼菲蓝状菌」。

第二次转入我院血液科前患者再次发热,根据经验性治疗,予「头孢哌酮舒巴坦钠+左氧氟沙星」方案抗细菌,考虑「马尔尼菲蓝状菌」可能未痊愈,跟家属商议后,在患者入院第 2 天送检,标本采用了体温正常时的外周血,在入院第 3 天既回报检出「马尔尼菲蓝状菌,序列数 2,相对丰度 0.2%」,与之对比,入院后多次血培养结果回报均为阴性。根据 mNGS 结果马上调整了治疗方案,改「两性霉素 B+头孢哌酮舒巴坦钠+左氧氟沙星」治疗, 患者未再发热,咳嗽、咳痰好转,血小板、红细胞上升,出院后口服伊曲康唑、氟胞嘧啶治疗,亦未再发热,为后续治疗慢性淋巴细胞白血病创造了良好的条件。

马尔尼菲蓝状菌是一种罕见的致病真菌,常发生于免疫功能低下的患者,特别是人类免疫缺陷病毒(HIV)感染或其他免疫宿主缺陷,若不及时治疗病死率高。真菌培养马尔尼菲蓝状菌病诊断的「金标准」,培养的标本可为患者的血液、骨髓液、活检组织等,根据疾病累及的部位分为局限型和播散型 2 类,临床上以播散型为主。治疗方案是先以两性霉素 B 以 0.6 mg/(kg·d) 的静脉滴注 2 周,症状控制后改伊曲康唑以 400 mg/d 剂量口服 10 周。但本病的临床表现以「发热、贫血、消瘦」等没有特异性特征为主,并且真菌培养周期长,常常会漏诊、误诊,不利于临床诊治。恶行血液病患者存在不同程度的免疫功能低下,感染性疾病发生率高,并且经常出现重症感染,导致高致死率,若能早期、快速、精准诊断出感染性疾病的病原体,对精准用药、缩短住院时间、减少并发症和降低死亡率都至关重要。mNGS 是一种非靶向的广谱病原学筛查技术,可以将提取样本的全部核酸片段进行检测,不需要分离培养和纯化,与比传统方法相比,其有检测速度快、通量高、灵敏度高、覆盖范围广等优势,为患者的早期诊断及治疗提供了实验依据,大大提高了临床治疗的精准性。