QmNGS 诊断烟曲霉感染一例
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2021-11-22

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第一部分:病例描述

主诉:患者王 XXX, 男,56 岁,咳嗽咳痰伴胸闷胸痛 20 余天。

现病史:患者 20 余天前无明显诱因出现咳嗽咳痰伴胸闷胸痛,为白沫痰,量多,曾有痰中带血,无发热畏寒,至徐州市矿山医院就诊查心电图示: 快速房颤,约 216 次/分,ST-T 改变。查胸部 CT 示: 右肺感染性病变,右肺上叶部分实变,纵膈肿大淋巴结。行抗感染、抑酸、化痰等输液治疗后好转,口服胺碘酮纠正房颤至今,后复查胸部 CT(2021-01-28,矿山医院) 示: 右肺上叶感染性病变,部分实变,纵膈肿大淋巴结,右侧胸膜腔积液,肝脏、右肾囊性实变。今患者为求进一步诊治入住我院,病程中患者咳嗽咳痰伴胸闷胸痛,为白沫痰,量多,曾有痰中带血,无发热、畏寒,无头痛、头晕,无盗汗,进食及睡眠可,大小便未见明显异常,近期体重未见明显变化。

既往史:平素健康状况一般,发现房颤 10 余天,口服胺碘酮 1 片#tid,尼可地尔 1 片#tid,瑞舒伐他汀 1 片#qn,否认肝炎、结核等传染病史,否认高血压、糖尿病、癫痫等慢性病史,否认手术、外伤、输血史,否认食物、药物过敏史,预防接种史不详。

初步诊断:1. 肺部阴影待查 1.1 肺炎?1.2 肺癌?2. 心房颤动 3. 冠状动脉粥样硬化性心脏病? 

 

第二部分:常规检测结果、常规病原学检测结果等

2021-02-01:

【心电图】HR 68bpm T 波改变;心脏彩超 (2021-02-02):EF61%,二尖瓣反流 (轻度),三尖瓣反流 (轻度),室间隔基底段轻度增厚。

【血气分析】酸碱度 7.44 ,二氧化碳分压 41.0(mmHg),氧分压 82(mmHg), 阴离子间隙 7(mmo1/L)↓,碳氧血红蛋白 1.7(%)↑,氧和血红蛋白 94. 2(%)↓,还原血红蛋白 2.9(%),高铁血红蛋白 1.2(%),肺泡动脉氧分压 16(mmHg), pH 体温校准 7.440,二氧化碳(T) 41.0(mmHg),Ca++(7.4) 1.15(mmo1/L) ,碳酸氢根 27.8(mmo1/L)↑,HC03std 27.4 (mmol/L), 二氧化碳总量 29.1(mmol/L), BEecf 3.6(mmo1/L)↑, 剩余碱 3.3(mmo1/L)↑, pA02  0.84, 氧分压 82.0(mmHg),血糖 7.5(mmol/L)↑, 乳酸 0.9(mmol/L),钾 4.0(mmol/L),钠 135(mmol/L)↓,钙 1.13(mmol/L),氯 104.0(mmol/L)↑,氧饱和度 97(%),红细胞比积 33(%)↓,血红蛋白 124(g/L)↓,体温 37.0(℃),吸氧浓度 21.0(%),氧和指数 390↓;

2021-02-02:

【血常规+hsCRP(快速)】白细胞计数 7.4(10^9/L),中性粒细胞百分比 62.8(%),淋巴细胞百分比 26.7(%),单核细胞百分比 7.1(%),嗜酸粒细胞百分比 2.2(%),嗜碱粒细胞百分比 1.2(%)↑, 中性粒细胞计数 4.67 (10^9/L), 淋巴细胞计数 2.0(10^9/L),单核细胞计数 0.53(10^9/L),嗜酸细胞计数 0.16(10^9/L),嗜碱粒细胞计数 0.09(10^9/L)↑,红细胞计数 3.53(10^12/L)↓,血红蛋白 112(g/L)↓,红细胞比容 34.4(%) ↓,平均红细胞体积 97.5(fl),平均血红蛋白含量 31.7(pg),平均血红蛋白浓度 326(g/L) ,红细胞分布宽度 S 48.8(fl) ,红细胞分布宽度 13.6(%),血小板分布宽度 7.9(%)↓ ,血小板计数 674(10^9/L)↑ ,血小板压积 0.57(%)↑ ,平均血小板体积 8.4(fl),大型血小板比率 11.8 ↓,C 反应蛋白 (快)33.8(mg/L)↑;

【心肌酶+电解质 (血)+肝功+降钙素原检测 (PCT)+脑钠肽+肾功+eGFR+血糖 (0.0 空腹)】谷草转氨酶 26(U/L),谷丙转氨酶 43(U/L),谷氨酰转肽酶 73(U/L)↑,碱性磷酸酶 131(U/L)↑,白蛋白 40.1(g/L),总胆红素 4.0(umo1/L);【胸苷激酶 1(TK1) 测定】胸苷激酶 1 测定:2.31(pM)↑;肺功能 (2021-02-02):VC 3.08 ,FEV1/FVC 69%,FEV1 实际/预测 78%,MVV 实际/预测  65%,RV/TCL 38%,DLco 实际/预测 (HB)65%,诊断意见: 轻度阻塞性通气功能障碍,残总比增高,弥散功能降低,可逆试验阳性 ((13.3%)。

【凝血功能 2(7 项)】抗凝血酶 III 活性 106(%),凝血酶原时间 11.3  (sec),百分活动度 98.5(%),凝血酶原时间比值 0.98, 国际标准化比值 0.98,活化部分凝血活酶时间 27.0(sec),纤维蛋白原 7.040(g/1)↑,凝血酶时间 15.6(sec), D-二聚体 (仪器法) 1.42(ug/mL)↑, 纤维蛋白原降解产物 6.10(mg/L)↑;

2021-02-02:

【CT 胸部增强】右肺上叶、下叶背段不规则片状影(感染性病变?),建议:抗炎治疗后复查。两肺小结节,炎性可能,建议:随诊复查。左肺散在肺大泡影;两肺散在条索影。

【糖化血红蛋白+抗碱血红蛋白测定(HBF)】葡萄糖化血红蛋白 [HbA1c] 6.70(%)↑,抗硷血红蛋白 0.70(%);

【T 淋巴细胞亚群检测 CD3/CD4/CD8】CD4 细胞绝对计数 472(个/微升), CD8 细胞绝对计数 520(个/微升),CD3 细胞绝对计数 1044(个/微升),CD4/CD8  0.91;

【肺部肿瘤六项】癌胚抗原 [CEA] 3.19(ng/ml),糖类抗原 [CA125] 71.82(U/ml)↑,神经元烯醇化酶 [NSE] 12.88(ng/ml),肺癌抗原 [CYFRA21-1] 4.16(ng/ml)↑,鳞状细胞癌相关抗原 [SCCA] 1.27(ng/mL),胃泌素释放肽前体 [Pro-GRP] 40.99(pg/ml);

2021-02-02:

【T 细胞因子检测(12 项)】IL-1B 4.93(pg/ml),IL-2 1.83 (pg/m1), IL-4 <1.41(pg/m1), IL-5 7.38(pg/ml)↑, IL-6 3.97(pg/m1), IL-8 7.10(pg/ml),IL-10  1.74(pg/ml),IL-12p70  2.43(pg/ml),IL-17  2.09(pg/ml), IFN-a  2.12(pg/ml),IFN-y  26.84(pg/ml)↑,TNF-a  5.65(pg/ml)↑;

2021-02-03: 

【病毒全套】乙肝表面抗原 0.000(IU/ml), 乙肝表面抗体 65.30(mIU/ml)↑, 乙肝 e 抗原 0.000(PEIU/ml),乙肝 e 抗体 0.070(PEIU/ml),  乙肝核心抗体 1.484 (PEIU/ml)↑, 乙肝前 S1 抗原 0.03 阴性, 丙肝抗体 0.020 阴性, 戊型肝炎抗体 IgM 0.04 阴性, 艾滋抗原抗体联合检测 0.070 阴性, 梅毒抗体 0.010 阴性;

【结核特异性γ干扰素】结核γ干扰素 (CLIS) 1.00(pg/ml), 阴性对照 (N) 6 (pg/ml), 测试值 (T) 7 (pg/ml), 阳性对照 (P) >5000 (pg/ml);

2021-02-04:

【结核分枝杆菌及耐药基因快速检测】结核分枝杆菌 DNA 阴性,利福平耐药检测 未检出;

【涂片找抗酸杆菌+涂片找霉菌】未找到抗酸杆菌,未找到真菌;

2021-02-06:

【血常规+hsCRP(快速)】白细胞计数 6.3(10^9/L),中性粒细胞百分比 58.4(%),淋巴细胞百分比 29.4(%),单核细胞百分比 7.4(%),嗜酸粒细胞百分比 3.7(%),嗜碱粒细胞百分比 1.1(%)↑, 中性粒细胞计数 3.67 (10^9/L), 淋巴细胞计数 1.8(10^9/L),单核细胞计数 0.46(10^9/L),嗜酸细胞计数 0.23(10^9/L),嗜碱粒细胞计数 0.07(10^9/L)↑,红细胞计数 3.59(10^12/L)↓,血红蛋白 114(g/L)↓,红细胞比容 34.9(%) ↓,平均红细胞体积 97.1(fl),平均血红蛋白含量 31.7(pg),平均血红蛋白浓度 326(g/L) ,红细胞分布宽度 S 49.7(fl) ,红细胞分布宽度 14.7(%),血小板分布宽度 15.3(%) ,血小板计数 490(10^9/L)↑ ,血小板压积 0.36(%)↑ ,平均血小板体积 7.4(fl),大型血小板比率 9.5 ↓,C 反应蛋白 (快)3.7(mg/L);

 

第三部分:mNGS 检测

2021-02-05,入院 4 天送检  标本类型:肺泡灌洗液

 

第四部分:鉴别诊断

患者目前肺部阴影待查,考虑以下:1. 肺炎?: 患者为老年人,病人初有咳嗽症状,抗感染治疗后症状减轻,入院完善血常规、CRP、痰病原学检查了解病情。2. 肺癌?:患者老年男性,吸烟,无明显毒性症状,反复咳嗽、有痰中带血,右肺上叶部分实变,肺癌不能完全排除,入院完善胸部增强 CT、血肿瘤性指标,必要时支气管镜检查进一步排除。3、肺结核: 患者虽无盗汗、消瘦、乏力、发热等结核典型症状,但有咳嗽、咳痰,不排除结核,可完善痰找抗酸杆菌,必要时行气管镜刷片找抗酸杆菌协助诊断。

 

第五部分:治疗经过及预后

入院后完善相关检查,血常规+hsCRP(快速)(2021-02-02): 白细胞计数 7.4(10^9/L),中性粒细胞计数 4.67(10^9/),红细胞计数 3.53(10^12/L)↓,血红蛋白 112(g/L)↓,血小板计数 674(10^9/L)↑,c 反应蛋白 (快)33.8(mgL)↑,心肌酶+电解质 (血)+肝功+降钙素原检测 (PCT)+脑钠肽+肾功+eGFR+血糖 (0.0 空腹)(2021-02-02): 谷草转氨酶 26(U/L),谷丙转氨酶 43(U/L),间接胆红素 1.8(umo1/L),谷氨酰转肽酶 73(U/L)↑,碱性磷酸酶 131(U/L) ↑;肺部肿瘤六项 (2021-02-02): 糖类抗原 [CA125]71.82(U/m1)↑,肺癌抗原 [CYFRA21-1]4.16(ng/m1)↑;T 细胞因子检测 (12 项)(2021-02-02):IL-5  7.38(pg/m1)↑,IFN-y 26.84( pg/m1)↑,TNF-a 5.65(pg/m1)↑;血气分析 (RICU)(2021-02-01): 氧和血红蛋白 94.2(%)↓, 碳酸氢根 27.8(mmo1/L)↑,BEecf 3.6(mmo1/L)↑,剩余碱 3.3(mmo1//L)↑,血糖 7.5(mmo1/L)↑;糖化血红蛋白+抗碱血红蛋白测定 (HBF)(2021-02-02): 葡萄糖化血红蛋白 [HbA1c]6.70(%)↑;凝血功能 2(7 项)(2021-02-02): 纤维蛋白原 7.040(g/1)↑,D-二聚体 (仪器法)1.42( ug/mL)↑,纤维蛋白原降解产物 6.10(mg/L)↑;胸苷激酶 1(TK1) 测定 (2021-02-02): 胸苷激酶 1 测定 2.31(pM)↑: 真菌 G 试验+GM 试验 (2021-02-03): 真菌 D-葡聚糖 37.500(-)(pg/m1);尿常规化学+尿沉渣定量检测、淋巴细胞群、结核特异性γ干扰素等未见明显异常;(2021-02-01) 心电图:HR  68bpm  T 波改变;(胸部增强 CT 2021-02-02): 右肺上叶、下叶背段不规则片状影 (感染性病变?),建议: 抗炎治疗后复查。两肺小结节,炎性可能,建议: 随诊复查。左肺散在肺大泡影;两肺散在条索;(2021-02-02) 心脏彩超:EF 61% 二尖瓣反流 (轻度),三尖瓣反流 (轻度),室间隔基底段轻度增厚。(彩超消化系统+双肾+腹腔腹膜后淋巴结 2021-02-03): 轻度脂肪肝声像肝多发囊肿声像胆囊壁毛糙,双肾多发囊肿伴钙乳沉积声像,双肾多发结石声像请结合临床。(彩超双侧肾上腺 2021-02-03): 双侧肾上腺区未示明显肿块声像请结合临床。肺功能 (2021-02-02):VC 3.08,FEV1/FVC 69%,FEV1 实际/预测 78%,MVV 实际/预测 65%,RV/TCL 38%,DLco 实际/预测 (HB)65%,诊断意见:轻度阻塞性通气功能障碍,残总比增高,弥散功能降低,可逆试验阳性 (13.3%)。排除禁忌后于 2021-02-04 行纤维支气管镜检查,气管: 管腔通畅,粘膜光滑,隆突嵴锐利;左侧:左主支气管及各叶段通畅,粘膜光滑,未见新生物;右侧: 右中叶支气管开口狭窄,支气管镜不能通过;右主支气管及其余各叶段通畅,粘膜光滑,未见新生物;液基细胞病理学 (2021-02-05): 未查见恶性肿瘤细胞,NGS 检测结果 (2021-02-06): 检测出微生物,副流感嗜血杆菌。予以抗炎抗感染、雾化、止咳、祛痰等对症支持治疗,患者住院期间多次复查血常规示血小板高,电话联系血液科会诊,考虑与肺部感染有关,建议定期复查,后复查血常规+hsCRP(快速)(2021-02-06): 白细胞计数 6.3(10^9/L),中性粒细胞计数 3.67(10~9/L),红细胞计数 3.59(10^12/L)↓,血红蛋白 114(g/L)↓,血小板计数 490(10^9/L)↑,C 反应蛋白 (快)3.7(mg/L)。建议患者复查胸部 CT,患者及家属表示暂不复查。现患者咳嗽咳痰较前好转,要求出院,请示上级医师后准予办理。

 

案例总结:  

流感嗜血杆菌可以导致多种类型的临床感染。该菌可在局部蔓延引起非侵袭性疾病,如无菌血症的肺炎、中耳炎、鼻窦炎和结膜炎;还可导致更为严重的侵袭性疾病,如脑膜炎、败血症、有菌血症的肺炎。
本患者为 CAP 患者症状表现与此符合,使用莫西沙星后患者好转,NGS 技术在重症肺炎中能够减轻患者经济负担以及治疗时间。